El actor reveló en noviembre del 2024 que padecía un cáncer colorrectal, desde el momento en que dio a conocer su diagnóstico, utilizó su plataforma para concienciar sobre su enfermedad, buscaba mantener un vínculo cercano con sus seguidores y compartir su experiencia de una manera abierta y sincera.
Van der Beek tenía seis hijos con su esposa, Kimberly.
El actor es más conocido por interpretar el papel principal en el drama adolescente "Dawson´s Creek", que se emitió de 1998 a 2003. Recientemente, tuvo apariciones especiales en un episodio de 'Walker' y en la película de Tubi 'Sidelined: The QB and Me'.