Pachuca se estabilizó en Primera División a finales de los años 90, comenzó a jugar Liguillas, comenzó a jugar finales y comenzó a eliminar al América.
Los Tuzos han vuelto a despachar a las Águilas en una serie de eliminación directa, lo que ya se ha vuelto costumbre cada vez que estos equipos se encuentran, ya que es la sexta ocasión que esto sucede.
Verano 2001
En las semifinales los Tuzos bajo el mando de Javier Aguirre eliminaron por primera vez al América que tenía como DT al argentino Alfio Basile.
-Ida: Pachuca 2 – 0 América
-Vuelta: América 1 – 1 Pachuca
Clausura 2007
En la final del torneo, el Pachuca vuelve a pasar sobre las Águilas con un triplete, en los dos partidos, de Juan Carlos Cacho.
-Ida: América 1 – 2 Pachuca
-Vuelta: Pachuca 1 – 1 América
Clausura 2015
Duelo de uruguayos en las bancas y Diego Alonso, al frente de los Tuzos, mandó a su casa a Gustavo Matosas que estaba al mando del América, en una serie de cuartos de final con muchos goles.
-Ida: Pachuca 3 – 2 América
-Vuelta: América 3 – 4 Pachuca
Clausura 2021
La debacle de la era de Santiago Solari con el América llegó cuando se topó con los Tuzos de Paulo Pezzolano. En el global terminaron empatados, pero los pachuqueños avanzaron gracias a marcar más goles de visita. Extrañamente al siguiente torneo, esa regla se cambió.
-Ida: Pachuca 3 – 1 América
-Vuelta: América 4 – 2 Pachuca
*Pachuca avanzó por goles de visita.
Clausura 2022
Guillermo Almada comenzó a convertirse en el "coco" de las Águilas al echarlos en las semifinales, comenzando el calvario en esta ronda del argentino Fernando Ortiz.
-Ida: América 1 – 1 Pachuca
-Vuelta: Pachuca 3- 0 América
Champions Cup de Concacaf
Después de igual a un tanto en la ida, Pachuca con la carga de jugar partidos sin el descanso suficiente elimina al América de André Jardine, que pierde la posibilidad de ganar el doblete en el semestre.
-Ida: América 1 – 1 Pachuca.
-Vuelta: Pachuca 2 – 1 América