Dentro del programa estratégico forestal de San Luis Potosí 2006–2025, la sierra de San Miguelito está clasificada como una región prioritaria de conservación y protección de la biodiversidad, ante la recarga del acuífero de Villa de Reyes, la Zona Metropolitana de San Luis Potosí y Mexquitic de Carmona.
Después del incendio en la sierra de San Miguelito, continúan encontrando especies como el águila real, zorro gris, coyotes, lince rojo o gato montés, aves de presa como aguililla cola roja, halcones y el ardillón de roca.
Yvett Salazar Torres, titular de la Secretaría de Ecología y Gestión Ambiental (Segam) informó que la sierra representa una de las 60 montañas prioritarias para la producción de agua y captura de carbono.
Explicó que recientemente se obtuvo un área natural protegida, por lo que se tuvo un acercamiento con Bwild de México, para conocer la fauna silvestre de la zona, encontrando alrededor de 23 especies de mamíferos de tamaños medianos a grandes y 15 de aves y mamíferos pequeños.
El director general de Bwild México, Mauricio Sam Carrera manifestó que la localización y registro de fauna, se logró con la instalación de cámaras de fototrampeo en puntos específicos de la sierra, logrando el registro de especies, ya que al pasar un animal se activa y realiza una pequeña grabación.
Destacó que la fauna se mantiene saludable y poco abundante encontrando águila real, zorro gris, coyotes, lince rojo o gato montés, aves de presa como aguililla cola roja, halcones peregrinos, halcón de las praderas y ardillón de roca, el cual es una de las presas más fáciles.